麻醉机消毒是麻醉机日常保养的重要操作。每次使用麻醉机后都要进行必要的维护保养及消毒，这样做不但可以避免交叉感染也能提高设备使用寿命。
    麻醉机的消毒主要是外部设备表面及外币零部件的消毒和内部呼吸回路消毒。外部表面包括麻醉机机壳显示器等比较容易清晰及消毒，医用用75%的酒精进行擦拭消毒。另外设备呼吸回路部分每个麻醉机厂家的结构及材质不禁相同。有的厂家是整体金属结构可以拆卸下来进行整体的高温高压消毒。还有一种就是利用麻醉机回路消毒机进行消毒，在使用时将麻醉机回路与消毒机回路通过螺纹管进行链接，通过雾化进行消毒，一般在半个小时会完成一次对回路的消毒过程。
    麻醉机消毒的周期如何把握：所有设备没使用一次，都要进行必要的消毒和灭菌。以前麻醉机的消毒工作非常繁琐，需要把呼吸回路的各个部件拆卸进行清晰及消毒。现在随着麻醉机管路消毒机的普及使得这部分工作可以由机器完成。他是使用原理就是通过雾化把臭氧等消毒气体对回路进行消毒。
    除了麻醉机消毒，在呼吸回路中使用过滤器，可以一定程度上减小患者对呼吸机的污染，从而增加麻醉机消毒过程的效率。